Analiza kolonii bakteryjnych na pożywce ma w mikrobiologii bardzo duże znaczenie. Do liczenia kolonii bakteryjnych stosowane są liczniki automatyczne oraz urządzenia manualne i półautomatyczne z czujnikiem dotykowym i/lub szkłem powiększającym, występujące także w wersjach z kamerą i przetwarzaniem obrazu. Firma Shashin Kagaku oferuje cztery modele liczników automatycznych, PSF-1100, PSF-2100, PSF 5100 oraz PSF 7100. W zależności od wersji mają one kamerę o rozdzielczości 3, 5, 12 i 20 megapikseli. Pozwala to na osiągnięcie maksymalnej rozdzielczości 35 μm. Liczniki Shashin Kagaku mogą badać kolonie bakteryjne na szalkach Petriego (maksymalna średnica 152 mm), mediach typu Petri film, Compact Dry i Film Media, filtrach membranowych, płytkach i strefach inhibicji.